通俗的說，去離子水和蒸餾水是兩類水，而不是兩種水。
普遍來說蒸餾水的離子比去離子水高，去離子去過不經過紫外消毒或者濾膜的話，可能會帶點微生物，看具體工藝。
去離子水是用離子交換樹脂來去除水中的大量的陰陽離子,但是不能去除所有的離子。

而蒸餾水,是蒸汽遇冷凝結的,所以基本不含離子（氫離子和氫氧根離子除外）,所以蒸餾水的純度要比去離子水的高,你測電導率就可以知道蒸餾水的電導率要低。
一般分析的時候使用蒸餾水,而工廠生產是使用去離子水。

這兩種水的其他不同都是由制備方法不同所導致所以歸根結底就是制備方法不同。各方法做出來的水的純度都會隨著重復次數的增加而提高。純化任務要考慮的是原混合物的具體情況，選擇有針對性的純化方法。 所以，要比較的話，必須指明從什么水開始，經過幾次蒸餾或幾級滲透膜。而且膜也有很多種類。膜分離技術本身也在不斷發展中。用不同的膜除的是不同的東西，會為了除很冷門的物質而開發很冷門的膜。細菌就可以通過過膜而除去，并不一定非要紫外。純化不是向水中添加的物質，而是從水中除去的物質，所以成份有什么不一樣，也跟你拿什么水去純化有關。拿池塘水和自來水的結果當然就不一樣。

簡單地說，去離子水是把水中的鈉、鎂、鈣、鋅、鐵等離子去掉。看看礦泉水的包裝，肯定能看到這些離子的含量。把這些離子除去，對做研究來說，實驗結果就科學得多。對日常生活來說，水由“硬水”變成“軟水”，洗衣服的時候不起泡沫的問題得到解決，而且燒水的水壺也不會結垢，據說患結石的概率也會減少。在家庭里，往往是通過直飲水的離子柱產生離子水。一般都有一根柱子來出去細菌。

蒸餾水是要把水煮沸，水蒸氣在鍋蓋受冷變回水滴，把這些水滴收集起來就是蒸餾水了。
簡單總結就是，去離子水可以用蒸餾水代替，蒸餾水的等級高于去離子水，但要用蒸餾水的不能用去離子水！